Le malattie parassitarie si diffondono solitamente nei grandi allevamenti. I parassiti, come i pidocchi, i coccidi e gli acari di varia natura, si annidano nella cute, sotto il piumaggio, nell'intestino, nella trachea dei canarini, provocandone a seconda della parte colpita, ventre gonfio, piume danneggiate, nervosismo, irritabilità, eccessiva attività di pulizia, prurito, arrossamento della pelle, croste rugose giallastre e perdita parziale delle penne, diarrea, difficoltà respiratorie.